Выдвигая на первый план важность компьютеров в интерпретации генома человека, самая большая медицинская благотворительность исследования в мире поднимает $13 миллионов для финансирования аппаратного и программного обеспечения, разработанного для анализа недавно упорядоченной ДНК. 20 июля Wellcome Trust расположенный на территории Великобритании обязался поддерживать в течение 5 лет автоматизированный аналитический проект генома под названием Ensembl.Последовательный геном человека включает определение заказа миллионов основ – A, G, T, и C – вдоль каждой хромосомы. Но та последовательность имеет мало значения или значения, пока ученые не определяют местонахождение генов, которые эти основы кодируют и выясняют свои функции.
В прошлом году Тим Хаббард из Центра Sanger в Кембридже и Иване Бирни из европейского Института Биоинформатики, также в Кембридже, начал писать компьютерные программы, автоматически проанализировавшие последовательности генома. Программы предсказывают генные места и делают выводы о функциях протеинов закодированными теми генами.
До сих пор операция, которую они назвали Ensembl, «была проектом хитрости», говорит Хаббард без определенных фондов, отложенных для его развития. Но, учитывая, что черновой набросок генома человека фактически полон (ScienceNOW, 26 июня), «требование биоинформатики огромно», указывает он. С новым финансированием он планирует утроить штат Энсембла 10 и купить больше вычислительной мощности.«Эта премия ускорит аннотацию генома человека», предсказывают Дэвид Хаусслер, bioinformaticist в Калифорнийском университете, Санта-Круз.
Он – один из нескольких исследователей, координирующих их усилия анализа генома с группой Ensembl. Премия была первой, чтобы быть данной по новой инициативе Wellcome Trust за $150 миллионов в функциональной геномике и была сделана задолго до любых других, частично из-за чернового наброска. «Мы не чувствовали, что могли ждать», говорит Силия Колкотт, диспетчер программ Wellcome Trust.
Ссылка по темеДомашняя страница Ensembl