Международная команда ученых, каталогизировавших гены микроорганизмов, живущих в нашем пищеварительном тракте, установила это в 3,3 миллионах, они значительнопревзойдите численностью эти приблизительно 23,000 генов в геноме человека и скажите, что они надеются, что каталог поможет нам лучше понять, как хранить здоровый балансв нашей флоре пищеварительного тракта, а также улучшают диагноз и лечение болезни.Вы можете прочитать научную газету об этом в онлайновой проблеме 4 марта Природы. Исследование было скоординировано доктором Даско Эрлихом вInstitut National de la Recherche Agronomique, во Франции, и является совместными усилиями ученых, работающих над aЕвропейский проект под названием MetaHIT (Метагеномика Человеческого Кишечника) в сотрудничестве с доктором Юном Ваном и коллегами в Пекине
Институт геномики в Шэньчжэне, Китай.Кишечная палочка, один измного видов бактерий, найденных вчеловеческий пищеварительный тракт.
Флора пищеварительного тракта важна для здоровья человека. Названный «микробиом», это включает тысячи ломающиеся бактерий, грибов и другие микроорганизмытоксины, сделайте витамины и существенные аминокислоты, и создайте барьер против захватчиков.Чтобы получить всестороннюю картину разнообразия генов, существующих во флоре пищеварительного тракта, исследователи использовали метагеномный подход, где Вы берете образцыот среды Вы хотите изучить и затем упорядочить гены, которые они содержат.
Проблема состоит в том, как сделать это быстро, когда Вы имеете дело смиллионы генов.Один из научно-исследовательских центров, работающих над проектом MetaHIT, является европейцем
Лаборатория Молекулярной биологии (EMBL) в Гейдельберге, Германия. Они сказали прессе, что это – первый раз, когда исследование метагеномики использовало метод высокой пропускной способности под названием Illumina, которыйдругие думали, не будет выполнимо.
Процесс включает партии взятия и много коротких полос ДНК, сборка их в большие секции и затем сравнение их к известным последовательностямсохраненный в справочных базах данных и исключающий тех, которые, как известно, принадлежали геному человека.Для этого исследования исследователи использовали фекальные образцы от 124 европейцев. Некоторые доноры были здоровы, другие были страдающими ожирением или грузными и некоторыеимел воспалительное заболевание кишечника.Путем оценки среднего бактериального размера генома исследователи предсказали, что 3,3 миллиона генов флоры пищеварительного тракта, которые они посчитали, вероятно, представляют о aобщее количество приблизительно 1 000 видов микроорганизма, живущего в кишках всех участников.
Доктор Джордж Вайншток, генетик в Вашингтонском университете в Сент-Луисе, США, сказал NatureNews что:«Это – самый мощный микроскоп, это использовалось до сих пор, чтобы описать микробные сообщества».Исследование также показало много подсказок о том, как бактерии умеют оставаться в живых в довольно негостеприимной среде человекапищеварительный тракт.
Для большинства бактерий человеческий пищеварительный тракт не является хорошим местом, чтобы быть: это имеет низкий pH (очень кислый) едва любой кислород и никакой свет. Единственный способ процветать вотразвиться, и это исследование представило некоторые интересные подсказки о том, как они сделали это.
Исследователи нашли, что каждой отдельной бактерии нужны определенные гены, чтобы остаться в живых в человеческом пищеварительном тракте, но существуют также другие гены, которые должны бытьсуществующий у некоторых отдельных микроорганизмов, но не всех, для колонии, чтобы остаться в живых.Это могло объяснить другое интересное открытие. Исследователи нашли это, в то время как у отдельных участников исследования было только приблизительно 160 из 1 000 возможных разновидностей, приблизительно 40 процентов из любого одинразновидность флоры пищеварительного тракта участника также присутствовала приблизительно в 50 процентах других участников.
Исследователи думают один из интересных вопросов, которые должны быть исследованы, затем, прибывают ли эти общие гены из того же или изразличные бактерии среди различных людей.Они также надеются, что их генный каталог флоры пищеварительного тракта будет использоваться в качестве справочного ресурса для исследования генетических связей между бактериями пищеварительного тракта иопределенные болезни и структуры образа жизни, такие как диета.Создайте в соавторстве доктора пэра Bork, старший научный сотрудник и соедините лидера группы Структурной и Вычислительной Единицы Биологии в EMBL, сказал СМИ что:«Знание, какая комбинация генов необходима для правильного баланса микроорганизмов, чтобы процветать в пределах нашего пищеварительного тракта, может позволить нам использовать пробы фекалий,которые являются атравматичными как мера здоровья."«Однажды, мы можем даже быть в состоянии лечить определенные проблемы со здоровьем просто путем потребления йогурта с правильными бактериями в нем», добавил он.«Человеческий пищеварительный тракт микробный генный каталог, установленный метагеномным упорядочиванием».
Цзюньцзе Цинь, Жуйцян Ли, Йерун Рес, Manimozhiyan Arumugam, Kristoffer Solvsten Бургдорф, Chaysavanh Manichanh, триада Нильсен, мост Николаса,Флоренс Левенез, Тэкуджи Ямада, и др.Природа, 464, 59-65 (4 марта 2010)
DOI:10.1038/nature08821Источники: европейская лаборатория молекулярной биологии, NatureNews.