Стоимость упорядочивания всего генома человека продолжает резко падать. Полная Геномика, Маунтин-Вью, калифорнийская компания биотехнологии в прошлом году утверждала, что это скоро будет в состоянии продать полные последовательности генома человека всего за 5 000$ за штуку.
Это теперь появляется в пределах досягаемости. В завтрашней Науке компания сообщит, что это упорядочило три генома человека приблизительно за 4 400$ каждый, по крайней мере в стоимости реактивов. Такое дешевое последовательное могло значительно ускорить исследования, разработанные для точного определения генов, лежащих в основе сложных болезней.Быстродействующее падение последовательных цен может дать геномике эквивалент Закона Мура, описывающего, как число транзисторов на компьютерных микросхемах удваивается каждые 18 месяцев, постоянно ведя вниз стоимость вычислительной мощности.
В 2003 стоимость упорядочивания генома человека составляла приблизительно $300 миллионов. Это составляло до $1 миллиона в 2 007 и 60 000$ в прошлом году.Исследователи в Полной Геномике говорят, что они должны свой успех и для ускорения и низкое использование реактивов. Последовательная технология работает первым раскалыванием генома в одноцепочечные фрагменты ДНК и объединение их с отрывками известной синтетической ДНК так, чтобы они сформировали маленькие круги приблизительно 400 основ.
Каждый круг ДНК копируется много раз так, чтобы ДНК проветрила себя в шар на 200 миллимикронов. На эти «наношары ДНК» тогда нахлынули понижение, скопированное с липкими пятнами, разработанными для удерживания единственного шара в каждом пятне. Компания использует измененную версию стандартной последовательной технологии, прилагающей серию 10 основ долго флуоресцентно маркируемые отрывки ДНК к ДНК в шарах, позволяющей им решить последовательность оригинальной ДНК.
Те предоставляют им миллиарды последовательностей ДНК, каждая из которых приблизительно 35 основ долго. Компьютерная программа тогда ищет наложения между этими последовательностями для восстановления полного генома.
Преимущество метода, должностные лица компании требуют, состоит в том, что наношары собирают себя в ультраплотное множество, таким образом удерживая затраты реактива и ускоряя анализ флуоресцентных сигналов.Используя новую технологию, Закончите оценки руководителя исследовательских работ Геномики Рэдоуджа Драманэка, что компания скоро будет в состоянии упорядочить полный геном человека через приблизительно день. «Впервые это позволит большим количествам пациентов быть упорядоченными для добираний до сути относительно тысяч болезней, которыми генетически управляют», говорит Драманэк, который является также ведущим автором научной работы. Фактически, в понедельник, должностные лица компании объявили о сотрудничестве с исследователями в Институте Системной биологии в Сиэтле, Вашингтон, к геномам последовательности 100 пациентов с болезнью Хантингтона, самое большое исследование ассоциации болезни генома человека, проводимое до настоящего времени.
Роберт Кук-Дигэн, эксперт по политике геномики в Университете Дюка в Дареме, Северная Каролина, говорит, что после слушания такого большого количества обмана о Полных технологиях упорядочивания Геномики, впечатлен деталями. Но он также отмечает, что технология имеет коэффициент ошибок приблизительно одного в каждых 100 000 основ.
Геном человека содержит примерно 3 миллиарда писем, означая, что могли быть целых 30 000 ошибок. Таким образом, существует все еще комната на рынке для упорядочивания технологий, которые являются быстрыми, дешевыми, и еще более точными.