У междисциплинарной команды вокруг Патрика Мюллера в Лаборатории Фридриха Мишера Общества Макса Планка в Тюбингене, Германия, было новое взятие на этом виде эксперимента. В журнале Nature Communications они привлекают внимание к ограничениям существующих ранее аналитических инструментов для, СВЯЗЫВАЮТ испытание – и предлагают гибкую и точную альтернативу: их находящееся в открытом доступе программное обеспечение «PyFRAP».В СВЯЗЫВАЮТ испытание, время, когда флуоресцентные молекулы должны пополнить обесцвеченную область, измерено, в основном оценивая, как быстро темная типовая область становится яркой снова.
Однако оценка получающихся изображений микроскопа совсем не тривиальна: Молекулярное движение зависит, среди прочего, на форме окружающей среды. Если сложная структура приближена с упрощенными конфигурациями, чтобы облегчить анализ, предполагаемые коэффициенты распространения могут быть далекими фактические значения. PyFRAP работает без таких упрощенных предположений и вместо этого принимает более реалистические, трехмерные структуры во внимание.
Программа тогда численно моделирует эксперимент и использует классические алгоритмы, чтобы соответствовать моделированиям к результатам измерений.Доктор Александр Бла? le, ведущий автор публикации и его коллеги определили, что множество потенциальных проблем с током СВЯЗЫВАЕТ аналитические методы и обратилось к ним во время развития PyFRAP. Эта тщательность окупилась: По сравнению с альтернативными программами PyFRAP поставляет особенно надежные результаты, особенно при сложных условиях.
И его гибкие начальные условия также допускают оценку iFRAP данных (iFRAP: инверсия СВЯЗЫВАЕТ), относительно новая альтернатива, чтобы СВЯЗАТЬ, который менее вреден для тонких образцов.С доступностью более точного аналитического метода новые заявления на СВЯЗЫВАЮТ, или испытание iFRAP могло теперь возникнуть.
Авторы указывают, что их программное обеспечение может помочь исследовать взаимодействия между молекулами в живых организмах: Например, это могло помочь определить, замедлены ли молекулы, взаимодействуя с (возможно, до сих пор неоткрытый) обязательные партнеры.У PyFRAP есть потенциал, чтобы утвердиться как новая стандартная аналитическая программа в фундаментальном исследовании.
В любом случае это уже обеспечивает впечатляющий пример выгоды постоянного оспаривания установленным стратегиям и не быть удовлетворенным простыми, еще менее точными решениями.Программное обеспечение: программа PyFRAP доступна, чтобы загрузить бесплатно в следующих ссылках:http://www.fml.tuebingen.mpg.de/mueller-group/software.htmlhttps://mueller-lab.github.io/PyFRAP/