«В попытке раскрыть разнообразие форм нейрона, масштаб – очень большая и все более и более насущная проблема», говорит Хэнчуэн Пенг, доктор философии, Объединенный Следователь в Институте Аллена Мозговой Науки. «Нам необходимо сравнить десятки тысяч форм нейрона, чтобы действительно понять то, на что они похожи, и использовать ту информацию, чтобы разобрать отдельную клетку ‘типы’».Пенг и его команда проектировали UltraTracer, чтобы работать с существующими поисковыми алгоритмами нейрона, разработанными учеными во всем мире, зарядка турбо их, чтобы работать быстрее и с большими наборами данных.
В газете они описывают применение UltraTracer к десяти различным основным трассирующим снарядам и также к любым другим основным трассирующим снарядам в инициативе BigNeuron (bigneuron.org), разработанный различными людьми и используемые переменные методы, чтобы автоматически обнаружить формы нейронов в трехмерных стопках изображения.Команда смогла продемонстрировать уникальную способность UltraTracer перегрузить существующее программное обеспечение.
Используя Базу данных Типов Аллена Селла как биологическая ссылка, программное обеспечение сначала изучило то, на что «должны» быть похожими нейроны. UltraTracer тогда сделал существующие алгоритмы более эффективными, чтобы обращаться с более крупными наборами данных и объединил несколько различных алгоритмов органическим способом, который максимально использовал преимущества каждого трассирующего снаряда.«С UltraTracer мы даем новую жизнь поисковым алгоритмам нейрона, которые уже существуют и создание их еще более сильный», говорит Пенг. «Мы можем теперь проверить, как хорошо эти алгоритмы работа над очень крупными масштабами, и заставляют их работать лучше.
Это будет решающим шагом в обращении к фундаментальным вопросам о типах клетки в мозгу».