Как только о близком завершении генома человека объявили, комментаторы поддержали выплату нахождения генов для всех видов болезней. Но оба почти упорядоченных генома являются соединениями нескольких человек.
Это – все еще трудная задача выяснить, как гены данного человека отличаются от этого стандарта. Теперь новый инструмент может предоставить исследователям лучший способ точно определить возможные гены болезни на данной хромосоме – путем чтения побуквенной ДНК.Для генных охотников это относительно прямо для определения, где версия определенного гена находится на данной хромосоме.
Но люди несут две копии каждой хромосомы в каждой клетке, один от мамы и один от папы, и на определенных местах в гене может отличаться правописание в ДНК. Процесс выяснения, какие из этих генетических различий лежат на каждой хромосоме, называют haplotyping, и это – важный шаг к идентификации, какая версия гена может вызвать болезнь.
Прямо сейчас исследователи должны гаплотип путем анализа генофонда от больших семей, или в их частотах аллелей следа отсутствия в большом количестве людей, статистический процесс, который «подвержен ошибке», говорит генетик Эндрю Коллинз из университета Саутгемптона в Соединенном Королевстве.Ища практическую альтернативу, бригаду во главе с химиком Гарварда Чарльзом Либером и Массачусетский технологический институт (MIT), генетик Дэвид Хоусмен изменил популярный микроскоп, использующий ультраострый наконечник для картографирования крошечных поверхностей.
Они увенчали стандартный наконечник микроскопа с углеродной нанотрубкой – ультратонкий цилиндр атомов углерода приблизительно один всего лишь миллимикрон через. Исследователи помечают необычное правописание определенного гена с короткими берегами ДНК маркера, связанной с молекулой репортера, с готовностью обнаруживающейся в микроскопе.
Тогда они идут наконечник микроскопа вниз атомные холмы и долины хромосомы, и когда он поражает репортера, исследователи знают, что они прибыли в данный генетический вариант, они сообщают в июльском выпуске Биотехнологии Природы.Процесс является медленным, но генетики могут быть в состоянии создать множества сотен таких ультрачувствительных наконечников, работающих параллельно для выполнения ультрабыстрого haplotyping, говорит Либер.
Если такие усилия преуспевают, говорит Роберт Уотерстон, генетик, возглавляющий центр упорядочивания генома в Вашингтонском университете в Сент-Луисе, Миссури, метод «мог быть началом чего-то впечатляющего».