Самый нежелательный гость, ВИЧ проникает в хромосомы клеток, которые он заражает. Теперь, исследователи нашли, что вирус походит на партийного незваного гостя, прибывающего рано, но не помогающего с праздничными приготовлениями: новое исследование показывает, что ВИЧ предпочитает улаживать в разделы генома с активными генами, и затем заставляет их работать тяжелее. Результаты помогут ученым лучше понять, как ВИЧ тиражирует себя и вызывает болезнь.
ВИЧ размножается путем сжатия дубликата ДНК ее генома в хромосомы инфицированных клеток – обычно иммунная система T клетки. Исследователи долго задавались вопросом, как вирус выбирает, где уладить. Вначале, они смотрели для краткости определенные последовательности хромосомной ДНК.
Предположение было то, что ВИЧ мог бы направиться в предсказуемое место каждый раз. Никакая удача.
С готовностью последовательности генома человека, однако, вирусолог Фредерик Бушмен в Институте Salk в Сан-Диего, Калифорния, решил сделать широкую оценку хромосомных мест, в которые ВИЧ объединяется, надеясь придавить любимые места вируса.Бригада заразила культивированные клетки T достаточным количеством ВИЧ для получения одного или двух вирусов в каждую клетку. После 48 часов исследователи размололи ДНК и изолировали 524 региона ДНК, в которые объединялся ВИЧ. Тогда они упорядочили ДНК и нанесли на карту места на геноме человека.
ВИЧ, сажавший в генах 69% времени. Те гены произвели вдвое больше РНК также, как и чистые гены, указав, что интеграция поощряет гены к действию.
Кроме того, бригада нашла короткие хромосомные регионы, в которые ВИЧ уладил значительно чаще, чем другие. Эти интеграция «горячие точки» была всеми в областях, плотных с генами, они сообщают в выпуске 23 августа Клетки.Называя результаты категоричными и прямыми, вирусолог Майкл Мэлим в Королевском колледже в Лондоне, Великобритания, говорит, что работа поднимает много интересных вопросов, такой как, как ВИЧ выбирает и проворачивает активные гены, который «очень важен для понимания патогенеза». Ретровирусы должны объединяться для репликации эффективно, отмечает retrovirologist Джона Коффина в Медицинской школе Университета Тафтса в Бостоне, но никто не знает почему.
Если исследователи узнают, возможно они могут уволить партийного незваного гостя.