Все коронавирусы производят четыре основных структурных белка и несколько неструктурных белков. Тем не менее, большинство исследований SARS-CoV-2 на основе антител сосредоточено на шиповых и нуклеокапсидных белках. Исследование, опубликованное в журнале PLOS Biology Анной Хеффрон, Ирен Онг и коллегами из Университета Висконсин-Мэдисон, США.S., предполагает, что иммунные ответы могут развиваться против других белков, продуцируемых вирусом SARS-CoV-2.
Эффективность вакцин на основе шипованного белка варьируется, и не все, кто инфицирован SARS-CoV-2, вырабатывают обнаруживаемые антитела против шиповых белков или белков нуклеокапсида. Следовательно, расширенные варианты на основе антител могут сыграть важную роль в улучшении вакцин, диагностических и терапевтических средств, особенно с учетом появления новых вариантов. Чтобы выяснить, вызывает ли инфекция SARS-CoV-2 устойчивый антительный ответ против всех белков SARS-CoV-2, исследователи составили карту 79 "эпитопы"- специфические области вирусного протеома, которые антитела распознают и связываются с. Они также проверили, могут ли антитела, которые развиваются в ответ на SARS-CoV-2 или существующие антитела от предыдущих контактов с коронавирусами, связываться с любым из белков в шести других известных коронавирусах человека, чтобы идентифицировать потенциальные перекрестно-реактивные эпитопы.
Помимо белков-шипов и нуклеокапсидов, авторы обнаружили ранее неизвестные высокореактивные эпитопы В-клеток по всему спектру белков SARS-CoV-2 и других коронавирусов, что расширило потенциал для будущих вакцин и терапевтических разработок. Однако необходимы дальнейшие исследования, чтобы определить, как долго эти антитела сохраняются и отличаются ли ответы вакцинированных лиц от тех, кто заразился COVID-19 до вакцинации. Доктор. Онг и его коллеги продолжат изучение этих аспектов у взрослых и детей.
Хотя авторы прямо не описали варианты, вызывающие озабоченность, которые возникли с начала пандемии COVID-19, сравнение исходного генома SARS-CoV-2 с несколькими из вызывающих озабоченность вариантов выявило многочисленные вариации в регионах, которые находятся в или в пределах 3 аминокислот от идентифицированных связывающих антитело эпитопов.
По мнению авторов, "Наше обширное профилирование реактивности антител на уровне эпитопа у выздоравливающих субъектов с COVID-19, подтвержденное независимыми анализами, обеспечивает новые эпитопы, которые могут служить важными мишенями при разработке улучшенных диагностических средств, вакцин и терапевтических средств против вариантов SARS-CoV-2. вызывающие озабоченность, и опасные человеческие коронавирусы, которые могут появиться в будущем."